Pagsiklab ng Group C Rotavirus sa isang Paaralang Elementarya sa Luzhou, Tsina, at ang Teknolohiya ng Whole-Genome Sequencing ng Macro & Micro-Test ay Nagbibigay-daan sa Tumpak na Pagsubaybay sa Pinagmulan

Kamakailan lamang,Lingguhang CDC ng Tsinaay naglathala ng isang mahalagang artikulo sa pananaliksik na naglalarawan sa epidemiological at etiological na imbestigasyon ng isang acute gastroenteritis outbreak na dulot ng Group C rotavirus (RVC) sa isang elementarya sa Luzhou, Sichuan Province, noong Oktubre 2025. Kapansin-pansin, ang high-throughput targeted pathogen capture kit (probe-capture) at whole-genome enrichment sequencing technology ng Macro & Micro-Test ay gumanap ng mahalagang papel sa imbestigasyon. Sa pamamagitan ng pagpapagana ng tumpak na pagtukoy ng pathogen at komprehensibong genomic characterization, ang teknolohiya ay nagbigay ng kritikal na siyentipikong ebidensya para sa mabilis na pagkumpirma ng outbreak, tumpak na source tracing, at epektibong pagkontrol ng outbreak.

Pagsubok sa Makro at Mikro

Biglaang Pagsiklab: Unang Naiulat na Pagsiklab ng RVC sa Timog-Kanlurang Tsina

Noong ika-15 ng Oktubre 2025, isang matinding pagsiklab ng gastroenteritis ang naganap sa isang paaralang elementarya sa Luzhou. Ang paaralan ay may kabuuang populasyon na 1,943 na mag-aaral at kawani, na may 32 kaso na naiulat, kabilang ang 6 na kumpirmado sa laboratoryo at 26 na klinikal na nasuring kaso, na nagresulta sa pangkalahatang antas ng pag-atake na 1.65%. Ang pagsiklab ay umabot sa rurok sa pagitan ng ika-15 at ika-16 ng Oktubre, kung saan ang Class 7, Grade 5 ang nakaranas ng pinakamataas na antas ng pag-atake (23.08%). Karamihan sa mga pasyente ay mga batang nasa edad na ng paaralan (median age: 10 taon), na pangunahing nakakaranas ng pagsusuka (65.62%), pagtatae (46.87%), at pananakit ng tiyan (37.50%). Ang mga sintomas ay karaniwang tumatagal ng 1-3 araw, at lahat ng mga pasyente ay gumaling nang walang malubhang komplikasyon.

Unang Naiulat na RVC

Natukoy sa imbestigasyong epidemiolohikal ang index case bilang isang 11-taong-gulang na batang lalaki sa Baitang 7, Baitang 5. Ang kanyang nakababatang kapatid na babae ay nagkaroon na ng mga katulad na sintomas bago pa siya, na nagmumungkahi na ang pagkalat sa bahay ang unang pinagmumulan. Ang hindi sapat na pamamahala sa suka sa loob ng kampus—kabilang ang direktang pagwawalis at pagtatapon nang walang napapanahong pagdidisimpekta o paghihiwalay sa lugar—kasama ang mahinang kalinisan ng kamay sa mga estudyante, ay malamang na nagpadali sa karagdagang pagkalat. Karamihan sa mga apektadong silid-aralan ay matatagpuan sa pagitan ng ikalawa at ikalimang palapag at magkakatabing banyo ng mga lalaki, na nagpapahiwatig na ang parehong aerosol at contact transmission ay maaaring nakaambag sa pagkalat.

Naging partikular na mapanghamon ang imbestigasyon dahil ang regular na screening ng pathogen, kabilang ang mga pagsusuri para sa norovirus at Group A rotavirus, ay nagbunga ng mga negatibong resulta, na nagpapahiwatig na isang hindi pangkaraniwang pathogen ang may pananagutan.

Diagnosis na Pinagmulan: Natutukoy ng Whole-Genome Sequencing ng Macro & Micro-Test ang Salarin

Negatibo ang unang pagsusuri para sa norovirus. Kasunod nito, gumamit ang Luzhou CDC ng isang multiplex gastrointestinal pathogen real-time PCR assay na may kakayahang sabay-sabay na matukoy ang 28 pathogen, kabilang ang 8 virus, 17 bacteria, at 3 parasito, upang i-screen ang walong clinical sample. Noong Oktubre 17, anim na sample ang nagpositibo sa Group C rotavirus, na matagumpay na natukoy ang causative pathogen.

Upang higit pang matunton ang pinagmulan ng pagsiklab, isinagawa ng mga imbestigador ang parehong nanopore metagenomic sequencing at ang probe-capture whole-genome enrichment sequencing ng Macro & Micro-Test sa limang positibong sample. Matagumpay na nakabuo ang pamamaraang ito ng limang kumpletong RVC genome sequences (SC01–SC05). Ang pinagsamang estratehiya ng mabilis na multiplex PCR screening na sinundan ng high-resolution whole-genome sequencing ay nagbigay ng matibay na teknikal na suporta para sa tumpak na molecular epidemiology at source tracing.

Mga Pananaw sa Siyensya: Unang Pagtukoy sa M2 Genotype sa Timog-Kanlurang Tsina

Batay sa mataas na kalidad na datos mula sa buong genome na nabuo gamit ang teknolohiya ng Macro & Micro-Test, iniulat ng pangkat ng pananaliksik ang ilang mahahalagang natuklasang siyentipiko:

Pagkumpirma ng isang monoclonal outbreak:Ang lahat ng limang viral isolates ay nagbahagi ng magkaparehong whole-genome genotype (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), na may 0–1 single nucleotide polymorphism (SNP) na pagkakaiba lamang, na siyang nagpapakita na ang pagsiklab ay nagmula sa iisang transmission chain.

Pagtuklas sa genotype ng M2:Ipinakita ng pagsusuring pilohenetiko na ang mga strain ng Luzhou RVC ay kabilang sa M2 genotype sa halip na ang M3 genotype na dating itinuturing na nangingibabaw sa mga strain ng RVC ng Tsina. Hinahamon ng natuklasang ito ang kumbensyonal na pag-unawa sa distribusyon ng RVC genotype sa Tsina at kinukumpirma ang paglitaw ng M2 genotype sa timog-kanlurang Tsina.

Katibayan ng mga internasyonal na koneksyon sa transmisyon:Ang paghahambing ng buong genome ay nagpakita ng mataas na pagkakatulad sa henetiko sa pagitan ng mga strain ng Luzhou at mga strain ng RVC na naiulat dati sa Yunnan (2025), Novosibirsk, Russia (2017), at Italy (2012), na nagmumungkahi ng pagkakaroon ng isang aktibong network ng transmisyon ng Eurasian.

 

Katibayan ng mga internasyonal na link ng transmisyon

Mga Implikasyon para sa Pag-iwas at Pagkontrol: Mahalaga ang Maagang Pagtuklas at Mabilis na Interbensyon

Kasunod ng pagtukoy ng pathogen, agad na nagpatupad ang Luzhou CDC ng mga komprehensibong hakbang sa pagkontrol, kabilang ang paghihiwalay ng kaso, pagdidisimpekta sa kapaligiran, standardized na pamamahala ng suka, at pansamantalang pagsuspinde ng klase. Matagumpay na napigilan ang pagsiklab sa loob ng isang panahon ng incubation, nang walang karagdagang mga kaso na naiulat pagkatapos ng Oktubre 21.

Ang imbestigasyon ay nagbibigay din ng isang mahalagang aral sa kalusugan ng publiko: para sa mga clustered gastroenteritis outbreak na negatibo ang resulta sa pagsusuri para sa parehong Group A rotavirus at norovirus, ang Group C rotavirus at iba pang non-Group A rotavirus ay dapat isama sa routine diagnostic screening.

Ang pag-aaral na ito ay kumakatawan sa unang naiulat na Group C rotavirus outbreak sa timog-kanlurang Tsina at ang unang pagkakakilanlan ng M2 genotype sa rehiyon, na nagpapalawak ng kasalukuyang pag-unawa sa epidemiology ng RVC sa Silangang Asya. Sa imbestigasyong ito, ang pinagsamang solusyon ng Macro & Micro-Test na pinagsasama ang multiplex PCR screening na may whole-genome enrichment sequencing ay nagpakita ng makabuluhang praktikal na halaga sa pamamagitan ng pagpapagana ng parehong mabilis na pagkakakilanlan ng pathogen at high-resolution molecular source tracing, na nagbibigay ng isang maaaring kopyahing teknikal na balangkas para sa tumpak na imbestigasyon at pagkontrol ng mga susunod na pagsiklab ng mga nakakahawang sakit.

 


Oras ng pag-post: Hulyo-30-2026