Unang Pagsusuri sa Traceability na Batay sa Buong Genome ng Brucella abortus sa Lalawigan ng Zhejiang – Nag-ambag ang Bioinformatics Team mula sa Macro at Micro-Test sa Magkasamang Publikasyon

—— Pag-aaral na Pinagsama-sama ng Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, at China CDC. Inilathala sa Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Pangkalahatang-ideya ng Pag-aaral

Noong Mayo 2026, ang Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) ay naglathala ng isang papel na pinangunahan ng Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention (Zhejiang CDC), kasama ang pangkat ng bioinformatics mula sa Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. at ang National Institute for Communicable Disease Control and Prevention (China CDC) bilang mga kapwa-may-akda. Ang pag-aaral ay pinamagatang:
"Pagkilala at pagsusuring pilohenetiko ng pitong uri ng Brucella abortus sa Zhejiang, Tsina."
Brucella abortus

Ang pag-aaral na ito ay kumakatawan sa unang sistematiko, whole-genome-based phylogenetic traceability analysis ng Brucella abortus (B. abortus) sa Lalawigan ng Zhejiang, Tsina. Sinuri ng pangkat ang pitong isolates na nakolekta mula 2015 hanggang 2025 (apat na strain na nagmula sa tao at tatlong strain na nagmula sa baka mula sa Jinhua, Quzhou, at Ningbo). Ang mga natuklasan ay nagbibigay ng genomic na ebidensya para sa pinagmulan at mga ruta ng transmisyon ng "hilagang dominanteng species" na ito sa isang hindi tipikal na katimugang rehiyon ng epidemya sa silangang Tsina.

 

Kaligiran at Kahalagahan

 

Ang Brucellosis ay isang sakit na zoonotic na dulot ng bacteria ng genus na Brucella. Pangunahing nakahahawa ang Brucella abortus sa mga baka ngunit maaari ring magdulot ng sakit sa mga tao. Sa Tsina, ang brucellosis ay nagpapakita ng malaking pagkakaiba-iba sa heograpiya: ang pinakamataas na insidente ay nangyayari sa mga hilagang probinsya (hal., Inner Mongolia, Shanxi, Heilongjiang). Sa kabaligtaran, ang mga timog na probinsya, kabilang ang Zhejiang, ay dating pinangungunahan ng Brucella melitensis, na may napakakaunting naiulat na mga kaso ng B. abortus. Ang pagkakaiba-iba sa rehiyon na ito ang dahilan kung bakit ang genetic characterization at source tracing ng B. abortus sa Zhejiang ay isang mahalagang prayoridad sa kalusugan ng publiko.

 

Mga Paraan at Pangunahing Natuklasan

Ang pangkat ng pananaliksik ay nagpatibay ng isang estratehiyang may maraming aspeto na pinagsasama ang molecular biology at bioinformatics:

1.Pagtukoy sa pathogen at pangunahing pag-type

Kinumpirma ng BCSP-31 gene PCR at AMOS-PCR na lahat ng pitong isolate ay B. abortus.

Ang multilocus sequence typing (MLST) batay sa siyam na housekeeping genes ay nagsiwalat na lahat ng isolates ay kabilang sa sequence type ST2, na nagpapahiwatig ng mataas na genetic homogeneity sa mga circulating B. abortus strains sa Zhejiang.
Pagtukoy sa pathogen at pangunahing pag-type

2.Pag-karakterisasyon ng buong genome

Isinagawa ang whole-genome sequencing sa platform ng Illumina NovaSeq. Ipinakita ng pagsusuri ng average nucleotide identity (ANI) na ang mga Zhejiang isolate ay may hanggang 99.99% na pagkakatulad sa reference strain na B. abortus 544.

Ang pan-genome analysis ay nagsiwalat ng isang lubos na napreserbang populasyon: 3,084 na core genes ang natukoy, kasama ang 10 shell genes lamang, at walang soft core o cloud genes ang natukoy.

图片1

 

3.Mga profile ng gene ng virulence at antimicrobial resistance

Isang kabuuang 68 na salik na may kaugnayan sa virulence ang hinulaan, na sumasaklaw sa mga klasikong pathway tulad ng LPS biosynthesis, ang T4SS secretion system, at ang BvrR-BvrS two-component regulatory system. Kapansin-pansin, lahat ng isolates ay walang adhesin genes na bmaA at btaF. Ang resistance gene analysis ay nakakita lamang ng mprF gene sa CARD database, at walang ibang resistance determinant na natukoy.

Kalamidad4. Rekonstruksyong pilohenetiko at pagsubaybay sa transmisyon

Inilagay ng core-genome single-nucleotide polymorphism (cgSNP) analysis ang mga Zhejiang isolate sa isang partikular na posisyon sa pandaigdigang phylogenetic tree. Ipinakita ng mga resulta na ang mga Zhejiang strain ay bumubuo ng isang monophyletic group kasama ang mga strain mula sa Russia, Mongolia, at ilang hilagang probinsya ng Tsina (Ningxia, Heilongjiang, Inner Mongolia, Hebei, Gansu, Beijing). Ang grupong ito ay nahahati pa sa tatlong magkakaibang subclade (Clade 1–3), na nagmumungkahi ng maraming magkakahiwalay na introduction event.

Rekonstruksyon ng pilohenetiko

Mga Konklusyon at Implikasyon

 

Ang pag-aaral na ito ay nagbibigay ng unang mataas na katumpakan na genomic dataset ng B. abortus sa Lalawigan ng Zhejiang at nagbubunga ng ilang mahahalagang konklusyon:

 

  1. Clear henetikong pinagmulan– Ang mga strain ng B. abortus na kumakalat sa Zhejiang ay kabilang sa ST2, lubos na napreserba sa genome, at kumakatawan sa isang tipikal na linya ng bovine brucellosis.

 

2. Evibentahe ng transmisyon sa iba't ibang rehiyon– Hindi sinusuportahan ng pagsusuring pilohenetiko ang pagkakaroon ng isang malayang endemikong lahi sa Zhejiang. Sa halip, mariing ipinahihiwatig ng datos na ang mga strain na ito ay nagmula sa hilagang Tsina at maaaring may parehong pinagmulang ebolusyonaryo sa mga strain mula sa Russia at Mongolia. Ang pagkakaroon ng tatlong subclad ay nagpapahiwatig ng maraming magkakahiwalay na kaganapan sa pagpapakilala.

 

3. Mga implikasyon sa kalusugan ng publiko– Binibigyang-diin ng mga natuklasan ang kahalagahan ng genomic surveillance para sa brucellosis kahit sa mga tradisyonal na hindi endemikong rehiyon tulad ng Zhejiang. Bagama't mababa ang kasalukuyang bilang ng kaso, ang mga high-resolution na kagamitan tulad ng cgSNP ay maaaring epektibong masubaybayan ang pinagmumulan ng mga imported na paglaganap at magbigay ng siyentipikong ebidensya upang maputol ang mga kadena ng transmisyon na nauugnay sa transportasyon ng mga alagang hayop sa pagitan ng mga probinsya.

 

Ang gawaing ito ay hindi lamang pinupunan ang kakulangan sa pananaliksik sa Lalawigan ng Zhejiang kundi nagbibigay din ng mga bagong baseline data para sa pagsubaybay sa pathogen at pagtatasa ng panganib ng brucellosis sa rehiyon ng Yangtze River Delta.

 

Impormasyon sa Papel:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Pagtukoy at pagsusuring pilohenetiko ng pitong uri ng Brucella abortus sa Zhejiang, Tsina. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Oras ng pag-post: Hunyo-10-2026