Isang kamakailang pag-aaral ng metagenomic ang nagsiwalat ng isang kahanga-hangang magkakaibang spectrum ng mga virus at bacteria na dala ng mga daga sa Lalawigan ng Heilongjiang, kabilang ang Lassa virus, Amur virus, Salmonella, at Yersinia pestis.
Ginamit ng pananaliksik angKit para sa Pagpapayaman ng Pathogen RNA mula sa Macro at Micro-Test, batay sa teknolohiya ng pagkuha ng probe. Sa pamamagitan ng piling pag-ubos ng host rRNA at iba pang nakonserbang mga fragment ng host, epektibong napanatili ng pamamaraan ang microbial RNA, na makabuluhang nagpabuti sa sensitivity ng pagtuklas ng pathogen. Ang hakbang na ito sa pagpapayaman ng pathogen RNA ay kritikal sa pagkamit ng mataas na rate ng pagtuklas at nagbigay ng matibay na teknikal na suporta para sa pagsubaybay sa pathogen.
Mga Daga: Mga Pangunahing Reservoir ng mga Sakit na Zoonotic
Ang mga daga ang pinakamayaman sa mga uri ng hayop at pinakamalawak na ipinamamahaging grupo ng mga mammal, na binubuo ng mahigit 2,000 uri sa buong mundo at bumubuo sa mahigit 40% ng lahat ng uri ng mammal.
Higit pa sa kanilang kahalagahan sa ekolohiya, ang mga daga ay nagsisilbing pangunahing imbakan at tagapagdala ng maraming zoonotic pathogens.Dahil ang mga tirahan ng mga daga ay kadalasang nagsasapawan sa mga kapaligiran ng tao—sa pamamagitan ng direktang kagat, kontak sa dumi, o hindi direktang pagkahawa sa pamamagitan ng mga pulgas at kuto—ang mga pathogen na taglay nila ay nagdudulot ng patuloy na banta sa kalusugan ng publiko.
Kapansin-pansin, mahigit 70% ng mga umuusbong na nakakahawang sakit ay nagmumula sa mga hayop, kung saan ang mga daga ang isa sa pinakamahalagang imbakan ng virus.
Rehiyon ng Hangganan ng Heilongjiang: Isang Pangunahing Linya para sa Pagsubaybay sa mga Patogen
Ang Heilongjiang, isang lalawigan sa hangganan sa hilagang-silangang Tsina, ay nagtataglay ng masaganang yaman sa ekolohiya at may mga hangganan sa maraming bansa. Ang kombinasyon ng mayamang biodiversity at madalas na paggalaw ng populasyon sa iba't ibang bansa ay lumilikha ng mga kanais-nais na kondisyon para sa pagkalat ng pathogen.
Sa pagitan ng Hunyo at Hulyo 2021, nakakolekta ang mga mananaliksik ng 67 ligaw na daga mula sa Bayan ng Hengdaohezi, Lungsod ng Mudanjiang. Kabilang sa mga sampol ang:
l20Apodemus peninsulae
l47Myodes rufocanus
Ang lahat ng mga ispesimen ay nakuha sa mga residensyal na lugar at mga nakapalibot na lupang sakahan, na nagpapakita ng malapit na ugnayan sa pagitan ng mga pamayanan ng tao at mga tirahan ng mga hayop.
Teknolohiya ng Pagpapayaman ng Pathogen: Pagtagumpayan ang Panghihimasok sa Background ng Host
Sa metagenomic sequencing, ang host RNA ay karaniwang nangingibabaw sa mga pagbasa ng sequencing, na nagtatakip sa mga signal ng pathogen na mababa ang kasaganaan.
Upang matugunan ang hamong ito, ginamit ng pag-aaral angKit para sa Pagtukoy ng Pathogen Metagenomic ng Macro & Micro-Test. Gamit ang teknolohiya ng pagkuha ng probe, ang mga partikular na idinisenyong probe ay nagbibigkis sa host rRNA at mga nakonserbang sequence, na nagbibigay-daan sa kanilang pagkaubos at sa gayon ay nagpapayaman sa microbial RNA.
Ang pamamaraang ito ay lubos na nagpabuti sa sensitivity ng pagtuklas ng pathogen, na nagpapahintulot sa downstream sequencing na mabawi ang mas mataas na proporsyon ng mga nabasang pathogen. Ang hakbang ng pagpapayaman ay naglatag ng matibay na pundasyon para sa tumpak na paglalarawan ng spectrum ng pathogen na dala ng mga daga.
Kasunod ng pagpapayaman, ang mga sample ng RNA ay sumailalim sa reverse transcription, pagbuo ng library, at high-throughput sequencing. Kasama sa bioinformatic analysis ang:
Pagsala ng genome ng host
Klasipikasyon ng taksonomiya gamit ang Kraken2
l Pagwawasto ng kasaganaan gamit ang Bracken
Ang daloy ng trabahong ito ay nakabuo ng isang komprehensibong profile ng mga komunidad ng viral at bacteria.
Mga Natuklasan sa Pananaliksik: Co-circulation ng Maramihang mga Virus at Bacteria
Mga Natuklasan Tungkol sa Virus
Ang mga virus na natukoy ay kabilang sa 21 pamilya ng virus, kabilang angArenaviridaeatHantaviridae.
Sa pamamagitan ngbagoGamit ang Megahit, 154 na viral contigs ang nabuo, kung saan 110 sa mga ito ay nakahanay sa 19 na virus mula sa walong pamilya.
In Apodemus peninsulae, ang mga sumusunod na virus ay natukoy:
l Arenaviruses: Lassa virus, Wenzhou virus, Gairo virus
l Hantavirus: Amur virus, Puumala virus
In Myodes rufocanus, Natukoy ang rat arterivirus at Amur virus.
Kabilang sa mga pathogen na ito:
Ang Lassa virus ay isang sanhi ng viral hemorrhagic fever, na may mga case fatality na umaabot sa humigit-kumulang 20%.
Ang Amur virus ay isa sa mga pathogen na responsable para sa hemorrhagic fever na may renal syndrome (HFRS). Iniulat ng Tsina ang pinakamataas na pandaigdigang pasanin ng mga impeksyon ng hantavirus.
Mga Natuklasan sa Bakterya
Isang kabuuang 1,051 na genera ng bakterya ang nilagyan ng anotasyon.
Ang pinakamaraming genera ay:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellaay isang pangunahing pathogen na dala ng pagkain, na responsable para sa tinatayang 9 milyong kaso ng tipus at humigit-kumulang 110,000 pagkamatay taun-taon sa buong mundo.
Yersinia pestis, ang sanhi ng salot, ay responsable para sa tatlong makasaysayang pandemya. Ang Lalawigan ng Heilongjiang ay kinikilala bilang isa sa mga natural na sentro ng salot ng Tsina at nananatiling isang prayoridad na rehiyon para sa pagsubaybay sa salot.
Kahalagahan ng Pag-aaral
Mga Kontribusyon sa Siyensya
Ang pag-aaral na ito ang unang ulat ng mga fragment ng Lassa virus at rat arteritis virus sa mga daga mula sa Heilongjiang, na nagpapalawak sa database ng pathogen na dala ng daga ng Tsina.
Sistematikong inilalarawan nito ang mga komunidad ng virus at bacteria sa mga lokal na populasyon ng daga, na nagbibigay ng baseline data para sa pagsubaybay sa mga sakit na zoonotic sa mga rehiyon sa hangganan.
Mga Implikasyon sa Kalusugan ng Publiko
Itinatampok ng mga natuklasan ang pangangailangan para sa patuloy na pagsubaybay at pagsusuri ng mga pathogenA. peninsulaeatM. rufocanus.
Ang datos ay nagbibigay ng siyentipikong ebidensya na sumusuporta sa mga estratehiya sa pagkontrol ng pinagmulan ng mga sakit tulad ng salot at hemorrhagic fever na may renal syndrome.
Mga Lakas ng Metodolohiya
Ang metagenomic sequencing ay nagbibigay-daan sa walang kinikilingang pagtuklas ng parehong kilala at nobelang mga pathogen.
Sa pag-aaral na ito, ang teknolohiya ng pagpapayaman ng pathogen ng Macro & Micro-Test ay nagpakita ng mahusay na pagganap, na epektibong nagpapahusay sa pagtuklas ng target na pathogen sa mga kumplikadong biyolohikal na sample. Kinukumpirma ng mga resulta ang kakayahan nitong suportahan ang mataas na sensitivity na pagkilala ng pathogen sa pagsubaybay sa wildlife.
Rekomendasyon ng Produkto
Batay sa matagumpay na aplikasyon nito sa pag-aaral na ito, ang Macro & Micro-Test Pathogen RNA Enrichment Kit ay lubos na inirerekomenda para sa pananaliksik sa metagenomic surveillance.
Sa pamamagitan ng mahusay na pag-ubos ng mga host nucleic acid at pagpapayaman ng mga microbial sequence, ang kit ay makabuluhang nagpapabuti sa sensitivity ng pagtuklas at kalidad ng datos. Ito ay kumakatawan sa isang mahalagang kagamitan para sa tumpak na pagtuklas ng pathogen sa mga kumplikadong sample at nagbibigay ng matibay na teknikal na suporta para sa pagsubaybay sa kalusugan ng publiko, pagtatasa ng panganib sa zoonotic, at kahandaan sa pagsiklab.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Oras ng pag-post: Mar-02-2026