Groundbreaking TB at DR -TB Diagnostic Solution ni #Macro & Micro -Test!

Isang bagong sandata para sa diagnosis ng tuberculosis at pagtuklas ng paglaban sa droga: isang bagong henerasyon na naka -target na pagkakasunud -sunod (TNG) na sinamahan ng pag -aaral ng makina para sa diagnosis ng hypersensitivity ng tuberculosis

Ulat sa Panitikan: CCA: Isang modelo ng diagnostic batay sa mga TNG at pag -aaral ng makina, na angkop para sa mga taong may mas kaunting bakterya na tuberculosis at tuberculous meningitis.

Pamagat ng Thesis: Tuberculous-target na susunod na henerasyon na pagkakasunud-sunod at pag-aaral ng makina: isang diskarte sa diagnostic na sensitive para sa pacific pulmonary tubulars at tubular meningitis.

Periodical: 《Clinica Chimica Acta》

Kung : 6.5

Petsa ng paglalathala: Enero 2024

Pinagsama sa University of Chinese Academy of Sciences at Beijing Chest Hospital ng Capital Medical University, ang Macro & Micro-Test ay nagtatag ng isang Tuberculosis Diagnosis Model Batay sa bagong henerasyon ng Target na Sequencing (TNGS) Technology at Machine Learning Paraan, na nagbigay ng ultra-high Ang sensitivity ng pagtuklas para sa tuberculosis na may kaunting bakterya at tuberculous meningitis, ay nagbigay ng isang bagong pamamaraan ng diagnosis ng hypersensitivity para sa klinikal na diagnosis ng dalawa Mga uri ng tuberculosis, at tumulong sa tumpak na diagnosis, pagtuklas ng paglaban sa droga at paggamot ng tuberculosis. Kasabay nito, natagpuan na ang plasma cfDNA ng pasyente ay maaaring magamit bilang isang angkop na uri ng sample para sa klinikal na sampling sa diagnosis ng TBM.

Sa pag -aaral na ito, 227 mga sample ng plasma at mga sample ng cerebrospinal fluid ay ginamit upang maitaguyod ang dalawang klinikal na cohorts, kung saan ang mga sample ng cohort ng laboratoryo ay ginamit upang maitaguyod ang modelo ng pag -aaral ng makina ng diagnosis ng tuberculosis, at ang mga klinikal na diagnostic cohort na mga sample ay ginamit upang mapatunayan ang itinatag, Diagnostic Model. Ang lahat ng mga sample ay unang na -target ng isang espesyal na dinisenyo na naka -target na capture probe pool para sa Mycobacterium tuberculosis. Pagkatapos, batay sa data ng pagkakasunud-sunod ng TB-TNGS, ang modelo ng puno ng desisyon ay ginagamit upang magsagawa ng 5-tiklop na cross-validation sa pagsasanay at pagpapatunay ng mga set ng laboratory diagnostic queue, at ang mga diagnostic thresholds ng mga sample ng plasma at mga sample ng cerebrospinal fluid ay nakuha. Ang nakuha na threshold ay dinala sa dalawang mga set ng pagsubok ng klinikal na diagnosis ng pagsusuri para sa pagtuklas, at ang diagnostic na pagganap ng mag -aaral ay nasuri ng curve ng ROC. Sa wakas, nakuha ang modelo ng diagnosis ng tuberculosis.

Fig. 1 diagram ng eskematiko ng disenyo ng pananaliksik

Mga Resulta: Ayon sa mga tiyak na threshold ng CSF DNA sample (AUC = 0.974) at sample ng plasma cfDNA (AUC = 0.908) na tinutukoy sa pag -aaral na ito, kabilang sa 227 mga halimbawa, ang pagiging sensitibo ng sample ng CSF ay 97.01%, ang pagtutukoy ay 95.65%, at Ang pagiging sensitibo at pagtutukoy ng sample ng plasma ay 82.61% at 86.36%. Sa pagsusuri ng 44 ipinares na mga sample ng plasma cfDNA at cerebrospinal fluid DNA mula sa mga pasyente ng TBM, ang diskarte sa diagnostic ng pag -aaral na ito ay may mataas na pagkakapare -pareho ng 90.91% (40/44) sa plasma cfDNA at cerebrospinal fluid DNA, at ang sensitibo ay 95.45% (42/44). Sa mga bata na may pulmonary tuberculosis, ang diskarte sa diagnostic ng pag -aaral na ito ay mas sensitibo sa mga sample ng plasma kaysa sa mga resulta ng deteksyon ng Xpert ng mga sample ng gastric juice mula sa parehong mga pasyente (28.57% kumpara sa 15.38%).

Fig. 2 Pagsusuri ng Pagganap ng Tuberculosis Diagnosis Model para sa Mga Sample ng Populasyon

Fig. 3 Mga resulta ng diagnostic ng mga ipinares na mga sample

Konklusyon: Ang isang hypersensitive diagnostic na pamamaraan para sa tuberculosis ay itinatag sa pag -aaral na ito, na maaaring magbigay ng isang tool na diagnostic na may pinakamataas na sensitivity ng pagtuklas para sa mga klinikal na pasyente na may oligobacillary tuberculosis (negatibong kultura). Ang pagtuklas ng hypersensitive tuberculosis batay sa plasma cfDNA ay maaaring isang angkop na uri ng sample para sa diagnosis ng aktibong tuberculosis at tuberculous meningitis (ang mga sample ng plasma ay mas madaling mangolekta kaysa sa cerebrospinal fluid para sa mga pasyente na pinaghihinalaang ng utak tuberculosis).

Orihinal na Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? sa pamamagitan ng%3dihub

Maikling Panimula ng Macro & Micro-Test Tuberculosis Series Detection Products

Sa pagtingin sa kumplikadong sample na sitwasyon ng mga pasyente ng tuberculosis at iba't ibang mga pangangailangan, ang macro & micro-test ay nagbibigay ng isang kumpletong hanay ng mga solusyon sa NGS para sa pagkuha ng likido mula sa mga sample ng plema, konstruksyon at pagkakasunud-sunod ng Qualcomm Library, at pagsusuri ng data. Sakop ng mga produkto ang mabilis na diagnosis ng mga pasyente ng tuberculosis, pagtuklas ng paglaban sa gamot ng tuberculosis, pag-type ng Mycobacterium tuberculosis at NTM, hypersensitivity diagnosis ng bacteria-negatibong tuberculosis at tuberculous na mga tao, atbp.

Mga serial detection kit para sa tuberculosis at mycobacteria:

Item no Pangalan ng Produkto nilalaman ng pagsubok ng produkto halimbawang uri naaangkop na modelo
HWTS-3012 Halimbawang ahente ng paglabas Ginamit sa paggamot ng likido ng mga sample ng plema, ay nakakuha ng isang numero ng record ng first-class, kagamitan ng makinarya ng Sutong 20230047. plema
HWTS-NGS-P00021 Qualcomm Dami ng Detection Kit para sa Hypersensitive Tuberculosis (Paraan ng Pagkuha ng Probe) Hindi nagsasalakay (likidong biopsy) hypersensitivity detection para sa bakterya-negatibong pulmonary tuberculosis at nodules ng utak; Ang mga halimbawa ng mga taong pinaghihinalaang nahawahan ng tuberculosis o non-tuberculosis mycobacteria ay nasuri sa pamamagitan ng mataas na malalim na pagkakasunud-sunod na metagenomics, at ang impormasyon ng pagtuklas kung ang tuberculosis o hindi-tuberculosis na mycobacteria ay nahawa ay ibinigay. Peripheral blood, alveolar lavage fluid, hydrothorax at ascites, focus puncture sample, cerebrospinal fluid. Pangalawang henerasyon
HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing at drug resistance detection kit (multiplex amplification sequencing paraan) Mycobacterium typing test, kabilang ang MTBC at 187 NTMAng pagtuklas ng paglaban sa droga ng Mycobacterium tuberculosis ay sumasaklaw sa 13 na gamot at 16 na mga pangunahing mutation site ng mga genes ng paglaban sa droga. Sputum, alveolar lavage fluid, hydrothorax at ascites, focus puncture sample, cerebrospinal fluid. Pangalawa/pangatlong henerasyon dual platform

Mga Highlight: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing at drug resistance detection kit (Multiplex Amplification Paraan)

Panimula ng produkto

Ang produkto ay batay sa pangunahing una-at pangalawang linya na gamot na inilarawan sa mga alituntunin ng paggamot ng WHO TB, macrolides at aminoglycosides na karaniwang ginagamit sa mga alituntunin sa paggamot ng NTM, at ang mga site ng paglaban sa gamot ay sumasakop sa lahat ng isang pangkat ng mga site na may kaugnayan sa paglaban sa gamot sa Sino ang Mycobacterium Tuberculosis Complex Mutation Catalog, pati na rin ang iba pang naiulat na mga gen ng paglaban sa gamot at mga site ng mutation ayon sa pagsisiyasat at istatistika ng mataas na pagmamarka Mga literatura sa bahay at sa ibang bansa.

Ang pag -type ng pagkakakilanlan ay batay sa mga strain ng NTM na naitala sa mga alituntunin ng NTM na inilathala ng Chinese Journal of Tuberculosis at mga sakit sa paghinga at ang pinagkasunduan ng mga eksperto. Ang dinisenyo na pag -type ng mga panimulang aklat ay maaaring palakasin, pagkakasunud -sunod at pag -annotate ng higit sa 190 species ng NTM.

Sa pamamagitan ng naka-target na teknolohiya ng pagpapalakas ng PCR, ang mga genotyping gen at mga gen na lumalaban sa gamot ng Mycobacterium ay pinalakas ng multiplex PCR, at ang pagsasama ng amplicon ng mga target na gen na napansin ay nakuha. Ang mga produktong pinalakas ay maaaring itayo sa pangalawang henerasyon o pangatlong henerasyon na mga aklatan ng pagkakasunud-sunod na pagkakasunud-sunod, at ang lahat ng pangalawang henerasyon at pangatlong henerasyon na mga platform ng pagkakasunud-sunod ay maaaring sumailalim sa mataas na pagkakasunud-sunod upang makuha ang impormasyon ng pagkakasunud-sunod ng mga target na gen. Sa pamamagitan ng paghahambing sa kilalang mga mutasyon na nilalaman sa built-in na database ng sanggunian (kasama ang WHO Mycobacterium tuberculosis complex mutation catalog at ang kaugnayan nito sa paglaban sa droga), ang mga mutasyon na may kaugnayan sa paglaban sa droga o pagkamaramdamin ng mga gamot na anti-tuberculosis ay tinutukoy. Pinagsama sa self-opened sputum sample na solusyon sa paggamot ng macro & micro-test, ang problema ng mababang nucleic acid amplification na kahusayan ng mga klinikal na sample ng plema (sampung beses na mas mataas kaysa sa tradisyonal na mga pamamaraan) ay nalutas, upang ang pag-aayos ng paglaban sa gamot ay maaaring maging direktang inilalapat sa mga klinikal na sample ng plema.

Saklaw ng pagtuklas ng produkto

34Ang mga gene na nauugnay sa paglaban sa gamot ng18gamot na anti-tuberculosis at6Ang mga gamot na NTM ay napansin, sumasakop297mga site ng paglaban sa gamot; Sampung uri ng Mycobacterium tuberculosis at higit pa sa190Ang mga uri ng NTM ay napansin.

Talahanayan 1: Impormasyon ng 18+6 na gamot+190+NTM

Kalamangan ng produkto

Malakas na kakayahang umangkop sa klinikal: Ang mga sample ng plema ay maaaring direktang napansin sa ahente ng self-liquefaction na walang kultura.

Ang eksperimentong operasyon ay simple: ang unang pag -ikot ng operasyon ng pagpapalakas ay simple, at ang konstruksiyon ng aklatan ay nakumpleto sa 3 oras, na nagpapabuti sa kahusayan sa trabaho.

Komprehensibong pag -type at paglaban sa gamot: sumasaklaw sa pag -type at mga site ng paglaban sa droga ng MTB at NTM, na kung saan ay ang mga pangunahing punto ng pag -aalala sa klinikal, tumpak na pag -type at pagtuklas ng gamot, pagsuporta sa independiyenteng software ng pagsusuri, at pagbuo ng mga ulat ng pagsusuri sa isang pag -click.

Pagkatugma: Pagkakatugma ng produkto, pag -adapt sa mainstream ILM at MGI/ONT platform.

Pagtukoy ng produkto

Code ng produkto Pangalan ng Produkto Platform ng pagtuklas Mga pagtutukoy
HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing at drug resistance detection kit (Multiplex Amplification Paraan) Ont 、 Illumina 、 Mgi 、 Salus Pro 16/96rxn

Oras ng Mag-post: Jan-23-2024